pfcc_extras view_nglのtips

from pfcc_extras import view_ngl
from ase.io import read

atoms = read("filepath.xyz")

v = view_ngl(atoms, representations=["ball+stick"])
v

バックグラウンドカラーの変更

v.view.background = 'white'     # "black"

bondの表示 / 非表示

v.view.add_ball_and_stick()
# v.view.remove_ball_and_stick()

カメラタイプの変更

v.view.camera= "perspective"    # "orthographic"

cell boxの表示 / 非表示

v.view.remove_ball_and_stick
# v.view.add_unitcell()

ball上に原子のindex表示

v.view.add_label(
    color="black", labelType="text",
    labelText=[atoms[i].symbol + str(i) for i in range(atoms.get_global_number_of_atoms())],
    zOffset=1.5, attachment='middle_center', radius=0.6)

回転

import numpy as np
v.view.control.spin([1,0,0.], np.deg2rad(-90))